Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHST12Q9NRB3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHST12Q9NRB3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms