Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan4Q9DCK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tspan4Q9DCK3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Tspan4Q9DCK3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tspan4Q9DCK3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tspan4Q9DCK3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tspan4Q9DCK3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tspan4Q9DCK3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tspan4Q9DCK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms