Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Phf8Q80TJ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms