Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CARMIL1Q5VZK9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CARMIL1Q5VZK9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms