Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TraddQ3U0V2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TraddQ3U0V2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms