Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CHRNA2Q15822 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
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