Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
AmbpQ07456 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms