Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP7AQ04656 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP7AQ04656 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms