Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PctpP53808 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PctpP53808 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PctpP53808 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PctpP53808 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PctpP53808 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms