Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFC4P35249 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFC4P35249 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFC4P35249 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFC4P35249 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC4P35249 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC4P35249 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC4P35249 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFC4P35249 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms