Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ggta1P23336 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ggta1P23336 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms