Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB4P16144 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms