Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Schip1P0DPB4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Schip1P0DPB4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms