Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm379J3QQ19 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm379J3QQ19 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Gm379J3QQ19 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Gm379J3QQ19 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm379J3QQ19 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm379J3QQ19 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm379J3QQ19 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Gm379J3QQ19 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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