Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WASHC2CQ9Y4E1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WASHC2CQ9Y4E1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms