Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Copg1Q9QZE5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Copg1Q9QZE5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms