Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnip1Q9JJ57 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnip1Q9JJ57 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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