Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMTK3Q96Q04 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMTK3Q96Q04 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms