Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trim38Q5SZ99 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim38Q5SZ99 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Trim38Q5SZ99 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trim38Q5SZ99 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trim38Q5SZ99 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Trim38Q5SZ99 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Trim38Q5SZ99 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trim38Q5SZ99 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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