Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GRIN2AQ12879 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GRIN2AQ12879 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
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