Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRPF1P55201 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRPF1P55201 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms