Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA10P31260 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms