Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KIAA0556O60303 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KIAA0556O60303 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms