Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms