Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN3Q9Y4C0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN3Q9Y4C0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN3Q9Y4C0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN3Q9Y4C0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRXN3Q9Y4C0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRXN3Q9Y4C0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms