Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Nectin3Q9JLB9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nectin3Q9JLB9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nectin3Q9JLB9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Nectin3Q9JLB9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nectin3Q9JLB9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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