Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP2Q96SN8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms