Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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