Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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