Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GAPVD1Q14C86 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
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