Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SgcgP82348 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms