Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CartptP56388 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CartptP56388 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CartptP56388 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CartptP56388 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CartptP56388 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms