Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr1cP52432 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms