Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H2afxP27661 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H2afxP27661 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms