Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Lgals6O54891 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Lgals6O54891 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms