Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPRTO14522 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPRTO14522 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms