Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tarbp1E9Q368 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tarbp1E9Q368 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms