Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top3bQ9Z321 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Top3bQ9Z321 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top3bQ9Z321 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Top3bQ9Z321 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Top3bQ9Z321 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms