Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptgdr2Q9Z2J6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptgdr2Q9Z2J6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptgdr2Q9Z2J6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptgdr2Q9Z2J6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms