Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Trip6Q9Z1Y4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
Trip6Q9Z1Y4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,24
Trip6Q9Z1Y4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Trip6Q9Z1Y4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Trip6Q9Z1Y4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Trip6Q9Z1Y4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trip6Q9Z1Y4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Trip6Q9Z1Y4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Trip6Q9Z1Y4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Trip6Q9Z1Y4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Trip6Q9Z1Y4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,5 ms