Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ap3b1Q9Z1T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Ap3b1Q9Z1T1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ap3b1Q9Z1T1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Ap3b1Q9Z1T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms