Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms