Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf394Q9Z1D9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Znf394Q9Z1D9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Znf394Q9Z1D9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf394Q9Z1D9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf394Q9Z1D9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms