Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1A9

Tbc1d8, TBC1 domain family member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d8Q9Z1A9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
Tbc1d8Q9Z1A9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Tbc1d8Q9Z1A9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Tbc1d8Q9Z1A9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Tbc1d8Q9Z1A9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Tbc1d8Q9Z1A9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,3 ms