Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Setbp1Q9Z180 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Setbp1Q9Z180 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Setbp1Q9Z180 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Setbp1Q9Z180 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36,43■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,4■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Setbp1Q9Z180 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36,38■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC36,33■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36,32■■■■□ 3,41
Setbp1Q9Z180 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Setbp1Q9Z180 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36,26■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36,25■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36,24■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Setbp1Q9Z180 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36,15■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Setbp1Q9Z180 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36,11■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC36,11■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Setbp1Q9Z180 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Setbp1Q9Z180 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC36,01■■■■□ 3,36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,9 ms