Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sumo3Q9Z172 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sumo3Q9Z172 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sumo3Q9Z172 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sumo3Q9Z172 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms