Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,53■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Pmfbp1Q9WVQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pmfbp1Q9WVQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27,38■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,3 ms