Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katna1Q9WV86 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Katna1Q9WV86 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Katna1Q9WV86 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Katna1Q9WV86 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Katna1Q9WV86 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Katna1Q9WV86 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Katna1Q9WV86 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katna1Q9WV86 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katna1Q9WV86 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Katna1Q9WV86 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms