Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VapaQ9WV55 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VapaQ9WV55 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VapaQ9WV55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VapaQ9WV55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VapaQ9WV55 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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