Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnip1Q9WUU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnip1Q9WUU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tnip1Q9WUU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tnip1Q9WUU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tnip1Q9WUU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnip1Q9WUU8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms